台北市長柯文哲上任後火速拆除忠孝西路公車專用道、台中市長林佳龍批BRT「兒戲、騙局」、嘉義市長涂醒哲廢除BRT公車專用道，
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，各縣市政府一連串「拿公車開刀」的舉動，
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，交通部今天「潑冷水」，
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，警告地方政府，
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，交通部自99年起補助各地方政府發展公共運輸，
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，若地方閒置或拆除，交通部不排除追討該項補助款，後續也不會再持續補助。
交通部補助台中BRT公車捷運系統1億8千多萬元、另補助嘉義縣BRT公車專用道設置站台、鋪設道路1億餘元，補助台北市蓋忠孝西路公車專用道工程費補助款2800萬元。交通部今天呼籲地方政府，在公共運輸相關建設拆或蓋都要謹慎，「不要說拆就拆、說建就建。」各地方政府在政策決定的同時，雖有兼顧私人運具使用便利、考量交通順暢，但仍應該以貫徹推動公共運輸發展為首要，審慎為之。
交通部從99年起推動公共運輸發展計畫，每年補助各地方政府共約40多億元，補助項目包括轉運站、車輛汰舊換新、建置多卡通、新闢路線及鄉鎮小巴等。，