海研五號研究船國慶日晚間在澎湖外海沉沒，
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，造成兩名研究員罹難，
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，事故原因尚待打撈船舶黑盒子解讀，
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，惟黑盒子未記錄駕駛艙對話，
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，澎湖地檢署坦言，
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，「比空難調查棘手」，檢察官只能盡可能蒐集所有證據拼湊，還原真相。
澎湖地檢署主任檢察官王鑫健說，飛機黑盒子能記錄塔台與飛行員，及周遭人員對話，有助釐清事故原因，但船舶黑盒子沒有這種功能，因此最關鍵的部分，就在事發當時海象差，為何還要出海，黑盒子完全沒有錄音紀錄，加上研究團隊的領隊許世傑不幸罹難，加深事故調查困難度。
澎湖地檢署朝人為過失偵辦，偵訊船長黃余發、大副林家威、探測長林嘉向、船副江政育及船員10多人，裁定黃10萬元交保、限制出境，至於會不會起訴，要等船舶黑盒子判讀，及最後整個證據調查的結果，才能確認。
他表示，外界指海研五號因「偏離航道觸礁」，地檢署不便評論，但不能單憑「航跡圖」就斷定是人為疏失，對當事人並不公平；包括船長怎麼畫航線、實際航跡、水文資料，都口說無憑，最明確的證據全在黑盒子。
檢察官希望儘快打撈黑盒子，航港局也很著急，不過，連日海象都不理想，何時下海作業，還是要尊重當地潛水夫的判斷。
有海事人員從航跡圖研判，海研五號觸礁前，以每小時11到12浬速度航行，在龍門外海撞上「外淺石」暗礁區，速度驟降到7浬，最後以剩不到1浬的速度漂流，很有可能顧著閃大浪，沒考慮到暗礁問題。，