聖嬰現象（EI Nino）造成中美洲面臨數十年來最嚴重的乾旱，
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，使巴拿馬運河仰賴輸入水量的湖泊水位降低。巴拿馬運河當局表示，
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，可能必須限制船隻通過的大小。
巴拿馬運河管理局（PCA）主管基塔諾（Jorge Luis Quintano）表示，
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，若乾旱持續下去，
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，PCA可能今年底前或明年初就必須限制超級貨輪通過。巴拿馬地區已不斷為乾旱災所苦，
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，氣象學家將原因歸咎於太平洋的聖嬰現象。
這場乾旱已導致數千隻牛死亡、農作物乾死，並迫使許多城市實施限電，因為水力發電廠已難以繼續發電，加上民眾的空調使用量大增。在最嚴重的災區，哥斯大黎加、宏都拉斯以及瓜地馬拉等國都已宣布進入緊急狀態。
這對巴拿馬來說是屋漏偏逢連夜雨。在這場乾旱危機發生之際，巴拿馬才剛化解擴建運河的爭議。
為了因應新一代超大貨輪，巴拿馬已投入逾52億美元擴建水道，將水道挖深1.2公尺，並在兩頭各設一個閘門，但工程進度已落後好幾個月，西班牙領導的施工團隊更指出，這項工程須耗費的資金可能比預期多16億美元。
巴拿馬在化解爭端時，乾旱問題卻又成為擴建工程的陰影。
基塔諾說，他期盼10月至12月的雨季能下更多雨，但去年11月的雨量卻是巴拿馬運河有史以來最少。，